《實施意見》指出，切實把科技創新擺在農業現代化建設突出重要位置，發揮新型舉國體制優勢，強化企業科技創新主體地位，加強創新資源統籌和力量組織，優化科技組織模式和創新范式，改善創新生態和科研環境，提升農業科技系統化組織水平和體系化攻關能力，實現高水平農業科技自立自強，為農業強國建設提供強有力的支撐。
《實施意見》強調，加快提升農業科技創新體系整體效能，必須堅持進一步全面深化改革，堅持農業科技公共性基礎性社會性定位，堅持產業需求導向，堅持守正創新，堅持人才引領發展。明確到2035年，建成運轉高效的農業科技創新體系，農業科技創新和產業創新深度融合，農業科技創新整體水平居于世界前列，實現高水平農業科技自立自強。
《實施意見》部署了八項重點任務。一是強化相關科研院所、高校科技創新核心使命，二是加快培育壯大農業科技領軍企業，三是優化農業科技創新組織機制，四是建強農業科技人才隊伍，五是提升農業科技條件支撐能力，六是加快農業科技成果轉化，七是推動農業科技高水平開放合作，八是改善農業科技創新生態。
《實施意見》要求，在中央科技委領導下，加強農業科技工作央地聯動和部際協調。各省（自治區、直轄市）結合實際建立農業科技管理協調機制，建立農業科研機構創新能力和省域農業科技創新效能監測機制，細化任務分工，強化工作調度，推動各項工作落實落地。
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